1. 膠塊未全部溶解：溶解凝膠時(shí)應置于55℃水浴，期間上下顛倒混勻數次，確定膠塊完全溶解后再進(jìn)行下一步驟。

  2. 膠塊太大（>400 mg）：如果需要處理的膠塊太大，應先將其切成小塊，然后分兩次回收。

  3. 電泳緩沖液pH值太高：硅膠膜在高鹽及低pH值（pH≤7.5）時(shí)可結合DNA，在低鹽及高pH值（pH≥8）條件下洗脫。如果電泳緩沖液pH值太高，會(huì )導致DNA無(wú)法結合或降低結合率?？稍谌苣z后加入3M乙酸鈉（pH 5.0）10μl，將pH值調至7.5以下。

  4. 漂洗液中未加無(wú)水乙醇：第一次使用前應在漂洗液中加入無(wú)水乙醇。漂洗液每次用后應擰緊瓶蓋，以免乙醇揮發(fā)，降低回收率。

  5. 洗脫緩沖液不合適：DNA只在低鹽溶液中才能被洗脫，如試劑盒中的洗脫緩沖液TE (10 mM Tris·Cl, pH 8.5)或水。洗脫效率還與pH值有關(guān)。最大洗脫效率在pH 7.0–8.5間。當用水洗脫時(shí)請確保其pH值在此范圍內。

  6. 洗脫緩沖液未加在離心柱中間，尤其使用較少量洗脫緩沖液時(shí)：應滴加在離心柱正中間，并放置1–2分鐘，再離心。